76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1385 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1385  sortase  100 
 
 
412 aa  845    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  59.37 
 
 
368 aa  425  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  43.18 
 
 
268 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  41.15 
 
 
270 aa  186  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  43.53 
 
 
276 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  40.73 
 
 
249 aa  173  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  39.61 
 
 
257 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  40 
 
 
260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  39.66 
 
 
266 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  35.34 
 
 
323 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  35.74 
 
 
238 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  42.7 
 
 
243 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  37.38 
 
 
234 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  37.62 
 
 
218 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  39.29 
 
 
192 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  36.61 
 
 
556 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  36.16 
 
 
238 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  35.34 
 
 
521 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  34.46 
 
 
312 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  33.48 
 
 
242 aa  124  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  33.77 
 
 
229 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  39.19 
 
 
251 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  33.33 
 
 
353 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  34.23 
 
 
286 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  28.48 
 
 
298 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
316 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  31.74 
 
 
268 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  30.77 
 
 
262 aa  96.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  31.07 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  28.89 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  36.59 
 
 
187 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  31.02 
 
 
225 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  36.59 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  32.16 
 
 
220 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  29.59 
 
 
268 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  29.55 
 
 
222 aa  60.1  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  30.88 
 
 
298 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  31.01 
 
 
209 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  27.55 
 
 
327 aa  56.6  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  29.3 
 
 
200 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  38.38 
 
 
215 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.87 
 
 
307 aa  54.3  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  34.62 
 
 
262 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  33.01 
 
 
302 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  28.67 
 
 
272 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  30.77 
 
 
267 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  23.8 
 
 
324 aa  53.1  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  30.77 
 
 
282 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  27.23 
 
 
270 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  29.37 
 
 
272 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  33.86 
 
 
218 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  29.29 
 
 
265 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  36.56 
 
 
269 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  29.81 
 
 
205 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  30.11 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  37.76 
 
 
263 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  30.07 
 
 
266 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  25.43 
 
 
344 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  29.47 
 
 
298 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  29.2 
 
 
286 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  28.57 
 
 
269 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  24.54 
 
 
223 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  35.4 
 
 
217 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  26.83 
 
 
266 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  31.25 
 
 
233 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  29.67 
 
 
207 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  26.73 
 
 
233 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  28.36 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  27.65 
 
 
236 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  27.27 
 
 
206 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  28.44 
 
 
301 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  30.77 
 
 
302 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  29.36 
 
 
238 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  31.07 
 
 
308 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  27.07 
 
 
238 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  26.25 
 
 
377 aa  43.1  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>