88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0035 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  100 
 
 
251 aa  495  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  45.58 
 
 
238 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  43.75 
 
 
368 aa  122  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  40.72 
 
 
266 aa  118  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  42.59 
 
 
323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  39.19 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  39.26 
 
 
276 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  38.41 
 
 
192 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  41.28 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  41.48 
 
 
242 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  37.93 
 
 
260 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  36.27 
 
 
257 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  37.58 
 
 
249 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  40.65 
 
 
238 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  35.06 
 
 
268 aa  99.8  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  40 
 
 
243 aa  98.6  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  41.18 
 
 
556 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  43.66 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  39.6 
 
 
521 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  40.94 
 
 
234 aa  95.1  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  32.64 
 
 
353 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  37.33 
 
 
229 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  35.23 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  31.41 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  40.14 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  33.78 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  33.8 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  32.77 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  31.21 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  31.21 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  33.87 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  33.53 
 
 
268 aa  68.6  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  31.14 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  33.06 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  27.7 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  27.86 
 
 
197 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  34.75 
 
 
262 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  29.85 
 
 
209 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  33.09 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.83 
 
 
307 aa  57.4  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  32.76 
 
 
238 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  31.03 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  35.4 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  30.43 
 
 
350 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  36 
 
 
195 aa  52  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  28.93 
 
 
327 aa  51.6  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  32.64 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  31.88 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  34.23 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  27.82 
 
 
324 aa  48.9  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 
207 aa  48.9  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  33.03 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  31.82 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  32.08 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  28.66 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  38.71 
 
 
263 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  33.33 
 
 
213 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  33.33 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  28.18 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  31.96 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  31.96 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.96 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.96 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.96 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.96 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.96 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.96 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  30.53 
 
 
305 aa  45.8  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  37.93 
 
 
328 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  32.35 
 
 
204 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  38.27 
 
 
218 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  29.63 
 
 
302 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  30.91 
 
 
232 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  30.91 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  23.79 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.96 
 
 
233 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  30.63 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.37 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  36.56 
 
 
193 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  34.4 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  27.82 
 
 
354 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  31.45 
 
 
216 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  29.41 
 
 
302 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.1 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  32.54 
 
 
217 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  26.19 
 
 
377 aa  42.4  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  35.06 
 
 
210 aa  42  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  34.82 
 
 
288 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>