93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1218 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  100 
 
 
250 aa  512  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  57.26 
 
 
247 aa  286  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  52.36 
 
 
253 aa  249  4e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  37.82 
 
 
234 aa  158  6e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  37.93 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
210 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
210 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
210 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
210 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
210 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
210 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
233 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  38.01 
 
 
210 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  38.18 
 
 
210 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  37.84 
 
 
210 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  37.73 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2089  sortase  29.65 
 
 
203 aa  85.5  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  28 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  30.43 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  29.2 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  28.51 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  31.01 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  27.9 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  34.21 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  27.56 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  30.22 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  28.27 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  33.82 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  28.9 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  35.11 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  34.35 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  33.08 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  24.79 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  34.11 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  26.55 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  28.64 
 
 
384 aa  65.9  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  32.37 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  34.35 
 
 
294 aa  65.1  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  30.43 
 
 
365 aa  65.1  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  29.41 
 
 
337 aa  65.1  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  29.41 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2603  sortase  30.61 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2551  sortase  30.61 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1128  sortase (surface protein transpeptidase)  23.26 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.513672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  28.51 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  28.51 
 
 
282 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  33.59 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  30.43 
 
 
381 aa  63.5  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.65 
 
 
307 aa  63.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1443  sortase (surface protein transpeptidase)  24.44 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0714  sortase (surface protein transpeptidase)  27.59 
 
 
331 aa  61.6  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0029312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  29.14 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  30.41 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  34.07 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  34.07 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  28.57 
 
 
339 aa  58.5  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  30.53 
 
 
291 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.82 
 
 
344 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  36.56 
 
 
218 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  34.33 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  34.41 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  31.34 
 
 
249 aa  55.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  29.09 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  32.41 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.31 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  23.02 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  27.17 
 
 
395 aa  53.5  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  30.97 
 
 
189 aa  53.5  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  31.43 
 
 
377 aa  53.1  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  32.98 
 
 
195 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  28.1 
 
 
556 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  32.26 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  30.28 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  32 
 
 
368 aa  50.4  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  30.2 
 
 
192 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  31.29 
 
 
242 aa  49.3  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  28.35 
 
 
187 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  31.11 
 
 
187 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  27.59 
 
 
336 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  30.95 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  27.61 
 
 
521 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  29.82 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  27.27 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  25.41 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  23.39 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  25.32 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  26.5 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  29.71 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  28.12 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  29.6 
 
 
209 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  21.95 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  26.13 
 
 
208 aa  42.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  35.48 
 
 
263 aa  42  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>