98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1003 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  100 
 
 		 301 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  76.29 
 
 		 288 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  48.97 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  39.87 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  36.63 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  27.14 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  37.36 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  33.6 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.03 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  32.18 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  38.4 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  26.83 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.83 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.83 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  26.83 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.83 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.83 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  37.88 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.42 
 
 		 210 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.42 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  36 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5062  sortase family protein  33.83 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000275463  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  28.46 
 
 		 187 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  34.07 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  28.46 
 
 		 187 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  25.83 
 
 		 210 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  35.94 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  25.76 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  35.11 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  26.47 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  29.14 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  34.64 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  38.64 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  37.5 
 
 		 192 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  36 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  25.86 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  28.45 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  29.09 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  28.72 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  30 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  38.89 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  31.73 
 
 		 197 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  25.88 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  29.05 
 
 		 412 aa  54.3  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  33.6 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  33.88 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  34.68 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  34.83 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  25.86 
 
 		 265 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  33.65 
 
 		 323 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  33.65 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  31.69 
 
 		 236 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  35.65 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  36.45 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  33.93 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  29.25 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  36.5 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  32.28 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2089  sortase  30.68 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  29.93 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  30.4 
 
 		 381 aa  50.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  30.85 
 
 		 235 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  33.02 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  37.14 
 
 		 218 aa  49.3  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  29.85 
 
 		 187 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  38.89 
 
 		 217 aa  49.3  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  31.2 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  31.18 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  37.08 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  29.85 
 
 		 178 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.89 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  35.2 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  38.1 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  35.2 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  36.36 
 
 		 268 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2603  sortase  30 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2551  sortase  30 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  34.97 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  38.26 
 
 		 195 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  31.11 
 
 		 238 aa  45.8  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  28.57 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  27.89 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  36.36 
 
 		 556 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  23.98 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  36.76 
 
 		 521 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  30.36 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  30.08 
 
 		 209 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  32.43 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  35.16 
 
 		 213 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  29.25 
 
 		 206 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.9 
 
 		 206 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  27.2 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  26.91 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  32 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  39.62 
 
 		 353 aa  42.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  35.71 
 
 		 215 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  34.18 
 
 		 270 aa  42.4  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  30.46 
 
 		 225 aa  42.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>