86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4170 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  100 
 
 		 238 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  74.55 
 
 		 235 aa  328  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  34.48 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  34.81 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  34.2 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  32.99 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  32.18 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  31.86 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5062  sortase family protein  31.98 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000275463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  32.5 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  36.45 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  31.79 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  34.07 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  33.58 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  34.23 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  32.05 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  32.76 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  30.77 
 
 		 321 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  35.14 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  31.05 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.33 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  29.92 
 
 		 395 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  28.65 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  22.97 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  28.09 
 
 		 556 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  29.73 
 
 		 302 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  31.21 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  34.88 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  32 
 
 		 339 aa  51.2  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  34.16 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  30.14 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  28.16 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  31.08 
 
 		 521 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  29.5 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  21.08 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  31.36 
 
 		 188 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  33.33 
 
 		 337 aa  49.7  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  32.84 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  31.49 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  25.33 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  28.52 
 
 		 368 aa  48.9  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  32 
 
 		 365 aa  48.9  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  26.99 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  28.65 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  29.15 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.33 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  30.77 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  31.62 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  29.55 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  28.91 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.49 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  28.93 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  28.22 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.15 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  32.14 
 
 		 377 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  31.03 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  27.69 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  35.23 
 
 		 377 aa  46.2  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  26.58 
 
 		 323 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  31.03 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  29.37 
 
 		 298 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  34.82 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.33 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  29.25 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  30.71 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  29.06 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  30.07 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  35.45 
 
 		 384 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  30.28 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  28.37 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  29.69 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  32.75 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  34.23 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.56 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  27.56 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.56 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  32.84 
 
 		 375 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.56 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  27.07 
 
 		 412 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  29.36 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  26.75 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  29.08 
 
 		 167 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  28.67 
 
 		 156 aa  42  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  30.13 
 
 		 216 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  28.87 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.95 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>