53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3472 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
156 aa  308  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  45.19 
 
 
222 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  44.76 
 
 
267 aa  113  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  41.73 
 
 
226 aa  100  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  40.4 
 
 
238 aa  99.4  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  42.18 
 
 
203 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  38.51 
 
 
214 aa  97.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  40.14 
 
 
220 aa  97.1  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  37.16 
 
 
167 aa  94  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  39.51 
 
 
214 aa  92.8  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  34.87 
 
 
368 aa  93.6  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  38.93 
 
 
279 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  38.26 
 
 
279 aa  91.7  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  37.5 
 
 
212 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  40.14 
 
 
243 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  37.06 
 
 
218 aa  87.4  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  35.9 
 
 
291 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  35.81 
 
 
208 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  37.5 
 
 
298 aa  86.3  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  37.75 
 
 
223 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  34.46 
 
 
284 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  35.9 
 
 
235 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  37.41 
 
 
235 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  36.24 
 
 
213 aa  80.9  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  36.24 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  39.74 
 
 
946 aa  77  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  31.72 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  33.11 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  34.97 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  36.18 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  31.76 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  31.72 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  33.77 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  32.43 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  33.57 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  34.27 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  32.93 
 
 
216 aa  70.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  37.66 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  37.06 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  37.93 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  35.66 
 
 
260 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  35.95 
 
 
213 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  27.21 
 
 
235 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  31.08 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  30.47 
 
 
226 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  32.8 
 
 
228 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  25.52 
 
 
228 aa  44.3  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  27.13 
 
 
375 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  28.67 
 
 
238 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
202 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  26.72 
 
 
244 aa  40.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>