57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  100 
 
 		 213 aa  433  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  50 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  50.34 
 
 		 276 aa  138  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  47.92 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  44.9 
 
 		 368 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  50.35 
 
 		 298 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  44.64 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  47.62 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  42.54 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  44.67 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  41.99 
 
 		 279 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  47.33 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  38.5 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  42.95 
 
 		 167 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  45.7 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  42.31 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  42.68 
 
 		 309 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  45.1 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  46.1 
 
 		 347 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  42.67 
 
 		 242 aa  121  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  49.65 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  39.62 
 
 		 245 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  41.61 
 
 		 291 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  40.69 
 
 		 284 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  44.22 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  45.86 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  43.24 
 
 		 178 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  43.05 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  40.56 
 
 		 247 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  40.56 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  40.27 
 
 		 946 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  38.82 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  35.29 
 
 		 321 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  40 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  44.14 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  37.7 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  37.93 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  36.81 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  36.99 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  36.24 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  36.88 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  31.29 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  29.63 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  30.38 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  32.91 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  33.33 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  30.83 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  28.17 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  28.64 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  28.8 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10380  hypothetical protein  32.89 
 
 		 282 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0366164  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  31.72 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  29.69 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  31.4 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  31.3 
 
 		 248 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  34.78 
 
 		 257 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  34.12 
 
 		 239 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>