53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3909 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
279 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  89.93 
 
 
279 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  60.27 
 
 
203 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  54.84 
 
 
212 aa  168  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  55.41 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  49.66 
 
 
188 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  42.47 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  43.83 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  48.25 
 
 
347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  43.33 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  46.2 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  46.71 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  38.93 
 
 
284 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  51.7 
 
 
167 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  47.68 
 
 
178 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  41.99 
 
 
213 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  46.67 
 
 
223 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  47.14 
 
 
298 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  48.32 
 
 
214 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  47.62 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  44.87 
 
 
235 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  46.58 
 
 
225 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  47.65 
 
 
242 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  42.86 
 
 
187 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  51.3 
 
 
196 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  46.36 
 
 
946 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  43.24 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  42.04 
 
 
235 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  40.4 
 
 
321 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  45.22 
 
 
216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  41.55 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  48.95 
 
 
192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  41.55 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  45.52 
 
 
210 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  38.93 
 
 
156 aa  92.8  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  41.38 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  41.43 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  39.44 
 
 
202 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  35.17 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  41.67 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  40.88 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  38.4 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  36.81 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  36.73 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  36.55 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  32.87 
 
 
243 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  39.02 
 
 
228 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  35.61 
 
 
226 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  33.75 
 
 
194 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  34.46 
 
 
228 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  31.85 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  35.03 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  34.78 
 
 
375 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>