55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3534 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 		 279 aa  544  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  89.93 
 
 		 279 aa  484  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  59.59 
 
 		 203 aa  175  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  54.19 
 
 		 212 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  54.78 
 
 		 214 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  51.01 
 
 		 188 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  43.15 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  48.95 
 
 		 347 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  44.67 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  46.84 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  44.52 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  39.19 
 
 		 284 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  46.05 
 
 		 208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  42.54 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  48.57 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  51.02 
 
 		 167 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  48.3 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  44.87 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  48.99 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  47.02 
 
 		 178 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  46.67 
 
 		 223 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  51.3 
 
 		 196 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  46.58 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  46.98 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  46.36 
 
 		 946 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  40.99 
 
 		 187 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  43.24 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  45.12 
 
 		 216 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  43.04 
 
 		 235 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  42.25 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  42.25 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  48.25 
 
 		 192 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  40.13 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  45.52 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  42.86 
 
 		 226 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  41.38 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  38.26 
 
 		 156 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  35.63 
 
 		 202 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  34.48 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  40.97 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  40.88 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  36.73 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  37.6 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  32.87 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  36.29 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  39.02 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  31.21 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  34.46 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  33.56 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  33.9 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  35.62 
 
 		 213 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  30.72 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  34.78 
 
 		 375 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  32.33 
 
 		 238 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>