45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2595 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 		 213 aa  410  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  45.83 
 
 		 241 aa  92.8  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  42.96 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  31.6 
 
 		 267 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  35.76 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  40.94 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  34.81 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  36.88 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  37.16 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  35.57 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2531  hypothetical protein  32.95 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0530439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  31.58 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  37.76 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  34.13 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  33.91 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3869  peptidase C60 sortase A and B  32.24 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0637874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1541  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.475087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  35.57 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  35.95 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  34.23 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  33.54 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  39.64 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  30.46 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  40.34 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  33.55 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  32.67 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  32.45 
 
 		 284 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  33.56 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  30.87 
 
 		 298 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  33.56 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  29.68 
 
 		 291 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  31.39 
 
 		 298 aa  48.5  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  33.5 
 
 		 279 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  31.29 
 
 		 276 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  32.89 
 
 		 347 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  28.87 
 
 		 309 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  34.73 
 
 		 279 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  31.72 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0855  peptidase C60, sortase A and B  28.57 
 
 		 299 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.991902  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  30.61 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  34.36 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  31.61 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  32.19 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  33.87 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>