56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6891 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  44.44 
 
 
368 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  47.64 
 
 
192 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  45.45 
 
 
203 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  42.86 
 
 
291 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  48 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  44.87 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  41.72 
 
 
298 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  46.58 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  45.95 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  47.62 
 
 
188 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  43.67 
 
 
223 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  44.87 
 
 
279 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  41.89 
 
 
208 aa  124  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  42.76 
 
 
187 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  45.95 
 
 
167 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  43.45 
 
 
178 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  37.33 
 
 
284 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  43.54 
 
 
214 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  38.46 
 
 
245 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  48.98 
 
 
196 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  40.52 
 
 
216 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  38.73 
 
 
247 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  42.42 
 
 
242 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  38.03 
 
 
247 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  41.88 
 
 
309 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  42.36 
 
 
210 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  41.13 
 
 
347 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  41.83 
 
 
946 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  36.55 
 
 
321 aa  99  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  39.86 
 
 
276 aa  99  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  35.76 
 
 
235 aa  95.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  37.7 
 
 
213 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  41.13 
 
 
267 aa  92  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  40.58 
 
 
226 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  35.9 
 
 
156 aa  85.9  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  36.49 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  39.57 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  34.43 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  40.74 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  35.62 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  37.1 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  35.81 
 
 
238 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  36.03 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  34.75 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  31.48 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  37 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  29.84 
 
 
144 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  29.65 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  43.37 
 
 
193 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  29.15 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  33.98 
 
 
202 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  31.67 
 
 
228 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  38.78 
 
 
257 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  38.89 
 
 
239 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  27.96 
 
 
251 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>