51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2482 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
196 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  63.69 
 
 
212 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  56.16 
 
 
368 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  50.34 
 
 
284 aa  167  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  53.95 
 
 
291 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  50.91 
 
 
223 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  55.94 
 
 
298 aa  158  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  51.52 
 
 
225 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  47.87 
 
 
188 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  50 
 
 
203 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  52.05 
 
 
178 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  51.3 
 
 
279 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  55.26 
 
 
309 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  50.64 
 
 
208 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  41.8 
 
 
187 aa  147  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  55.24 
 
 
347 aa  147  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  51.3 
 
 
279 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  57.34 
 
 
192 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  51.68 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  49.32 
 
 
247 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  49.67 
 
 
946 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  47.4 
 
 
214 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  49.32 
 
 
247 aa  138  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  46.75 
 
 
245 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  52.98 
 
 
216 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  48.98 
 
 
235 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  45.06 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  41.82 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  47.95 
 
 
242 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  48.97 
 
 
267 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  48.3 
 
 
167 aa  121  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  49.32 
 
 
210 aa  121  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  43.04 
 
 
235 aa  111  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  41.67 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  38.93 
 
 
321 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  43.75 
 
 
276 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  42.25 
 
 
226 aa  97.1  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  40.37 
 
 
218 aa  95.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  42.76 
 
 
220 aa  94.4  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  41.55 
 
 
241 aa  85.1  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  37.66 
 
 
156 aa  82  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  36.03 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  38.41 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  33.33 
 
 
144 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  31.13 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  33.11 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  30.77 
 
 
243 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10380  hypothetical protein  40.38 
 
 
282 aa  47.4  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0366164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  31.13 
 
 
235 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  35.17 
 
 
213 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  36.09 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>