43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4732 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
202 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  45.89 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  34.17 
 
 
279 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  37.35 
 
 
279 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  40.52 
 
 
291 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  45.04 
 
 
309 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  36.7 
 
 
188 aa  101  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  42.28 
 
 
247 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  42.28 
 
 
247 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  41.06 
 
 
946 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  35.71 
 
 
223 aa  95.1  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  34.76 
 
 
225 aa  95.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  40.14 
 
 
298 aa  95.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  34.83 
 
 
214 aa  92  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  39.68 
 
 
368 aa  91.7  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  45.33 
 
 
196 aa  91.3  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  31.76 
 
 
284 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  35.26 
 
 
276 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  36.36 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  36.36 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  36.49 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  39.86 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  34.93 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  39.19 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  38.46 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  42.19 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  33.33 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  38.58 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  37.91 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  32.75 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  34.62 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  35.1 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  36.47 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  36.8 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  30.23 
 
 
321 aa  65.1  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  32.03 
 
 
267 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  34.33 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  31.43 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  29.6 
 
 
226 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  31.21 
 
 
238 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  28.57 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>