62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0528 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
368 aa  711    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  54.23 
 
 
284 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  52 
 
 
298 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  58.22 
 
 
291 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  55.1 
 
 
212 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  50.69 
 
 
188 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  50.34 
 
 
203 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  48.99 
 
 
208 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  47.26 
 
 
245 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  45.39 
 
 
187 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  49.66 
 
 
214 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  56.16 
 
 
196 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  50.34 
 
 
214 aa  146  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  49.32 
 
 
347 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  47.3 
 
 
946 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  44.76 
 
 
178 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  46.98 
 
 
235 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  44.44 
 
 
235 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  44.14 
 
 
247 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  44.14 
 
 
247 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  43.15 
 
 
279 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  44.9 
 
 
213 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  46.53 
 
 
167 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  47.95 
 
 
309 aa  135  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  48.03 
 
 
216 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  43.75 
 
 
225 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  48.97 
 
 
192 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  42.47 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  43.62 
 
 
242 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  43.24 
 
 
223 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  44.74 
 
 
235 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  39.58 
 
 
276 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  46.26 
 
 
210 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  45.83 
 
 
267 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  41.84 
 
 
226 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  40 
 
 
220 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  42.66 
 
 
241 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  39.46 
 
 
218 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  34.87 
 
 
156 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  35.29 
 
 
222 aa  89.7  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  28.87 
 
 
321 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  39.52 
 
 
202 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  36.29 
 
 
144 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  32.87 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  35.76 
 
 
213 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  30.5 
 
 
194 aa  63.5  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  30.34 
 
 
238 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  32.67 
 
 
226 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  28 
 
 
260 aa  56.6  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  29.74 
 
 
228 aa  54.3  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  27.68 
 
 
251 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  32.31 
 
 
238 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  36.46 
 
 
243 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  36.92 
 
 
1977 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  28.97 
 
 
228 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  38.14 
 
 
244 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  34.02 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  32.24 
 
 
248 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10380  hypothetical protein  27.74 
 
 
282 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0366164  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  28.7 
 
 
746 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  33.01 
 
 
384 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.88 
 
 
1888 aa  43.1  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>