56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3164 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
208 aa  416  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  44.76 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  45.15 
 
 
223 aa  157  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  48.99 
 
 
368 aa  151  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  50.34 
 
 
203 aa  148  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  51.33 
 
 
212 aa  147  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  48.63 
 
 
284 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  42.15 
 
 
214 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  45.75 
 
 
245 aa  138  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  47.71 
 
 
214 aa  137  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  45.03 
 
 
188 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  46.05 
 
 
279 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  44.08 
 
 
946 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  46.71 
 
 
279 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  47.97 
 
 
167 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  47.14 
 
 
298 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  34.78 
 
 
178 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  51.02 
 
 
196 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  45.58 
 
 
276 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  41.89 
 
 
235 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  39.62 
 
 
187 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  46.34 
 
 
216 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  42.11 
 
 
291 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  47.97 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  42.96 
 
 
247 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  42.96 
 
 
247 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  48.25 
 
 
347 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  45.52 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  46.21 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  43.24 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  40.13 
 
 
242 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  40.71 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  38.67 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  43.45 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  40 
 
 
235 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  38.32 
 
 
220 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  36.57 
 
 
321 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  37.18 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  39.31 
 
 
241 aa  86.7  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  35.81 
 
 
156 aa  84.7  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  35.29 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  32.42 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  38.19 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  28.21 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  33.56 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  31.5 
 
 
144 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  30.97 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  33.56 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  30.71 
 
 
260 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  34.09 
 
 
251 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  27.63 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  35.64 
 
 
375 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  30.65 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  33.7 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1541  peptidase C60 sortase A and B  32.56 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.475087  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  31.96 
 
 
244 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>