56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1460 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 		 309 aa  595  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  70.34 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  53.7 
 
 		 188 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  56.67 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  53.9 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  55.26 
 
 		 196 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  50.68 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  47.95 
 
 		 368 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  43.42 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  46.84 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  39.53 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  48.59 
 
 		 167 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  46.2 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  48.97 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  44.74 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  46.99 
 
 		 216 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  53.85 
 
 		 192 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  46.34 
 
 		 203 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  46.85 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  47.18 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  43.15 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  45.39 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  44.87 
 
 		 178 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  42.68 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  41.96 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  45.21 
 
 		 946 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  45.64 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  42.53 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  46.21 
 
 		 208 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  45.71 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  45.71 
 
 		 247 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  43.45 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  40.38 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  41.72 
 
 		 235 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  38.67 
 
 		 187 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  43.88 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  37.43 
 
 		 220 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  46.03 
 
 		 202 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  40.71 
 
 		 218 aa  89.4  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  37.59 
 
 		 226 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  37.88 
 
 		 222 aa  86.7  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  34.97 
 
 		 156 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  29.25 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  35.77 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  28.37 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  33.55 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  32.88 
 
 		 251 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  36.72 
 
 		 384 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  33.51 
 
 		 238 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  34.65 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  34.03 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  31.08 
 
 		 228 aa  48.9  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  27.7 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  31.29 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  28.4 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  37.11 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>