67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0613 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
178 aa  351  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  58.66 
 
 
187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  54.67 
 
 
212 aa  158  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  48.86 
 
 
203 aa  155  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  47.97 
 
 
284 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  48.72 
 
 
214 aa  147  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  51.77 
 
 
298 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  44.76 
 
 
368 aa  141  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  52.08 
 
 
242 aa  141  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  45.7 
 
 
223 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  44.9 
 
 
225 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  51.41 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  43.43 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  47.68 
 
 
279 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  47.02 
 
 
279 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  47.55 
 
 
245 aa  127  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  40.65 
 
 
208 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  42.36 
 
 
291 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  44.87 
 
 
309 aa  124  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  52.05 
 
 
196 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  47.59 
 
 
946 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  43.45 
 
 
235 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  46.53 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  43.75 
 
 
276 aa  117  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  47.5 
 
 
210 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  45.14 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  45.52 
 
 
167 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  43.06 
 
 
347 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  43.24 
 
 
213 aa  114  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  42.55 
 
 
247 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  42.55 
 
 
247 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  40.82 
 
 
214 aa  110  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  39.16 
 
 
226 aa  99.4  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  37.63 
 
 
220 aa  97.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  39.86 
 
 
267 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  34.36 
 
 
321 aa  90.9  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  39.46 
 
 
218 aa  90.1  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  38.19 
 
 
235 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  41.26 
 
 
241 aa  88.2  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  37.23 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  32.88 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  40.31 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  34.69 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  33.12 
 
 
243 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  34.88 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  31.72 
 
 
228 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  30.71 
 
 
302 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  30.14 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  33.64 
 
 
260 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  31.75 
 
 
238 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  31.5 
 
 
298 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  31.75 
 
 
235 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  32.31 
 
 
226 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  37.66 
 
 
301 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  31.03 
 
 
228 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  35.71 
 
 
244 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  36.84 
 
 
243 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  42.53 
 
 
188 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  31.61 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  26.63 
 
 
251 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  31.33 
 
 
239 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  34.41 
 
 
288 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  35.14 
 
 
323 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  29.77 
 
 
214 aa  42  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  30.49 
 
 
257 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  28.57 
 
 
248 aa  40.8  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>