99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1727 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  100 
 
 
288 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  76.29 
 
 
301 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  50.53 
 
 
298 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  41.24 
 
 
302 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  34.27 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  36.53 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  33.57 
 
 
220 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  40 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  34.73 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5062  sortase family protein  32.79 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000275463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  37.6 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  32 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  37.68 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  32.8 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  32.18 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  35.11 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  35.21 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  34.75 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.2 
 
 
233 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  31.16 
 
 
253 aa  62.8  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  41.13 
 
 
249 aa  62.4  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  24.58 
 
 
210 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  24.58 
 
 
210 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  40 
 
 
238 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.58 
 
 
210 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  39.77 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.58 
 
 
210 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.85 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.85 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.15 
 
 
210 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.15 
 
 
210 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  22.77 
 
 
247 aa  59.7  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  36.54 
 
 
192 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  40.22 
 
 
242 aa  59.7  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  31.82 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  37.08 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  23.63 
 
 
210 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  31.33 
 
 
200 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  37.96 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  37.08 
 
 
266 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  31.73 
 
 
197 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  30.51 
 
 
222 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  25.44 
 
 
250 aa  55.8  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  33.08 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  33.83 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  32.09 
 
 
339 aa  53.9  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  26.99 
 
 
344 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  34.82 
 
 
251 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  31.2 
 
 
381 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  34.21 
 
 
205 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  32.45 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  30.19 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  31.11 
 
 
412 aa  50.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2089  sortase  32 
 
 
203 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  31.82 
 
 
234 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2603  sortase  32.05 
 
 
206 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2551  sortase  32.05 
 
 
206 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  34.58 
 
 
327 aa  49.7  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  33.33 
 
 
238 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  36.17 
 
 
210 aa  49.3  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  30.82 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  29.01 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  34.83 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  33.33 
 
 
365 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  37.5 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  36.76 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  38.89 
 
 
217 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  32 
 
 
242 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  29.77 
 
 
187 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  28.24 
 
 
269 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  34.09 
 
 
298 aa  46.2  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  33.33 
 
 
353 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  33.56 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  37.5 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  33.33 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  31.85 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  22.17 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  31.64 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  36.9 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  32.35 
 
 
384 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  36.22 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  28.57 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  28.03 
 
 
273 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  31.87 
 
 
229 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  34.62 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  28.03 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  31.19 
 
 
209 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  32.45 
 
 
235 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  24.79 
 
 
395 aa  43.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  29.1 
 
 
556 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  29.63 
 
 
178 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  31.71 
 
 
368 aa  43.1  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  37.76 
 
 
215 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  33.6 
 
 
276 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  31.34 
 
 
521 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  38.26 
 
 
195 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  36.7 
 
 
262 aa  42.4  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  28 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>