44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31940 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  100 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  63.45 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  47.89 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  35.1 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  34.71 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  36.29 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  37.3 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  40.4 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  33.06 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  36.36 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  32.43 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  34.17 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  31.17 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  32.11 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  34.46 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  35.66 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  34.48 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  40.34 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  35.17 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  34.73 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  32.67 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  32.64 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  33.06 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  34.21 
 
 		 946 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  33.11 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  29.36 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  28 
 
 		 368 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  38.4 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  34.74 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  28.87 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  31.61 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  32.73 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  33.11 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  32.35 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  32.33 
 
 		 178 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  28.12 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  26.98 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  32.35 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  29.6 
 
 		 188 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  27.7 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  30.65 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  32 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  27.36 
 
 		 291 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>