57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5005 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
347 aa  653    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  69.68 
 
 
309 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  56.03 
 
 
214 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  49.32 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  50.68 
 
 
276 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  54.11 
 
 
212 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  47.49 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  44.3 
 
 
245 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  50 
 
 
216 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  47.71 
 
 
279 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  44.31 
 
 
225 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  47.37 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  55.24 
 
 
196 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  44.76 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  50 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  47.26 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  49.66 
 
 
203 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  47.26 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  48.25 
 
 
223 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  47.95 
 
 
192 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  45.45 
 
 
210 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  46.1 
 
 
213 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  48.25 
 
 
208 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  49.3 
 
 
214 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  38.3 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  44.08 
 
 
946 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  45.52 
 
 
235 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  45 
 
 
247 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  45 
 
 
247 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  42.86 
 
 
178 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  44.14 
 
 
242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  39.19 
 
 
187 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  34.02 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  41.45 
 
 
235 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  41.13 
 
 
235 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  40.56 
 
 
218 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  38.37 
 
 
220 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  39.01 
 
 
226 aa  93.6  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  38.85 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  35.07 
 
 
222 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  38.3 
 
 
202 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  34.46 
 
 
194 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  37.3 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  35.77 
 
 
144 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  29.79 
 
 
243 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  27.66 
 
 
238 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  32.64 
 
 
260 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  32.21 
 
 
226 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  38.33 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  31.94 
 
 
228 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  35.62 
 
 
375 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  30.26 
 
 
228 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  40.91 
 
 
848 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
243 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  32.68 
 
 
248 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  32.89 
 
 
213 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  30.71 
 
 
238 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>