62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4636 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
220 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  78.65 
 
 
218 aa  305  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  51.03 
 
 
267 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  43.92 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  43.26 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  40 
 
 
368 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  41.61 
 
 
222 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  44.22 
 
 
241 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  37.63 
 
 
178 aa  98.2  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  39.31 
 
 
291 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  40.14 
 
 
156 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  34.87 
 
 
284 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  41.96 
 
 
298 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  38.16 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  36.25 
 
 
187 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  39.22 
 
 
225 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  39.86 
 
 
309 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  37.5 
 
 
321 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  38.67 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  37.84 
 
 
347 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  39.49 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  39.19 
 
 
167 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  36.81 
 
 
213 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  39.6 
 
 
192 aa  88.2  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  38.82 
 
 
188 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  39.19 
 
 
212 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  40.67 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  37.16 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  37.93 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  34.25 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  42.76 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  35.21 
 
 
247 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  35.21 
 
 
247 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  34.73 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  34.43 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  34.19 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  36.73 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  35.62 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  34.46 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  37.19 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  33.78 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  36.55 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  34.01 
 
 
946 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  34.75 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  36.88 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  31.41 
 
 
235 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  33.6 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  33.59 
 
 
144 aa  55.1  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  29.63 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  33.33 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  32.06 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  31.61 
 
 
375 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  32.28 
 
 
384 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  33.33 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  37.14 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  32.96 
 
 
350 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  32.5 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  34.21 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  35.14 
 
 
228 aa  42  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  28.43 
 
 
308 aa  41.6  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>