59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4659 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 		 267 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  44.22 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  49.66 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  48.92 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  45.83 
 
 		 368 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  46.1 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  45.99 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  38.8 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  46.53 
 
 		 208 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  43.45 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  46.1 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  50.34 
 
 		 192 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  44.76 
 
 		 156 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  46.1 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  34.89 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  44.59 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  48.97 
 
 		 196 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  45.45 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  39.58 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  41.14 
 
 		 216 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  44.06 
 
 		 167 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  43.51 
 
 		 214 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  43.66 
 
 		 347 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  43.75 
 
 		 188 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  37.65 
 
 		 223 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  39.01 
 
 		 321 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  36.49 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  36.48 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  40.13 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  39.31 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  35.96 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  39.47 
 
 		 178 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  37.93 
 
 		 213 aa  92.8  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  41.38 
 
 		 279 aa  92.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  36.72 
 
 		 194 aa  89  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  37.84 
 
 		 187 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  36.43 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  36.43 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  40.28 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  35.62 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  33.56 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  39.72 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  38.95 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  35.92 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  33.78 
 
 		 946 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  38.51 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  32.43 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  33.86 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  33.06 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  34.13 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  34.11 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  33.07 
 
 		 375 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  34.01 
 
 		 202 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  29.47 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  29.37 
 
 		 144 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  32.28 
 
 		 384 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  33.93 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  29.47 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  35.25 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>