64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3604 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  82.22 
 
 		 223 aa  343  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  55.41 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  53.29 
 
 		 188 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  49.04 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  51.76 
 
 		 192 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  51.37 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  50.34 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  55.86 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  47.77 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  46.48 
 
 		 298 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  47.06 
 
 		 946 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  44.9 
 
 		 178 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  47.59 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  49.32 
 
 		 276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  41.98 
 
 		 368 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  44.97 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  45.21 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  45.39 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  46.15 
 
 		 347 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  45.39 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  53.02 
 
 		 196 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  43.41 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  45.33 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  41.5 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  45.95 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  46.85 
 
 		 309 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  46.58 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  46.58 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  47.26 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  42.86 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  44.22 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  39.46 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  39.16 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  40.94 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  39.01 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  40.38 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  39.22 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  38.19 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  34.78 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  36.24 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  36.03 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  31.54 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  33.74 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  31.88 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  34.82 
 
 		 375 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  31.37 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  33.74 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  32.53 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  32 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  31.54 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  29.38 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  34.02 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  34.68 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  27.69 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  26.07 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  29.1 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  29.56 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  30.77 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  28 
 
 		 298 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  30 
 
 		 350 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  27.56 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1541  peptidase C60 sortase A and B  28 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.475087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  26.81 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>