61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0141 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
216 aa  421  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  53.75 
 
 
212 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  51.68 
 
 
188 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  54.05 
 
 
214 aa  141  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  52.74 
 
 
167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  50.33 
 
 
347 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  48.03 
 
 
368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  41.78 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  54.23 
 
 
210 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  47.4 
 
 
245 aa  128  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  46.01 
 
 
223 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  44.74 
 
 
284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  47.74 
 
 
309 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  44.74 
 
 
291 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  48.32 
 
 
298 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  42.47 
 
 
213 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  49.37 
 
 
192 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  46.84 
 
 
208 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  45.12 
 
 
279 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  52.26 
 
 
196 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  46.31 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  40.38 
 
 
187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  45.14 
 
 
178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  46.9 
 
 
276 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  41.76 
 
 
242 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  43.42 
 
 
235 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  44.17 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  44.51 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  46.71 
 
 
946 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  40.52 
 
 
235 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  41.89 
 
 
247 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  41.89 
 
 
247 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  43.23 
 
 
235 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  36.11 
 
 
321 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  41.61 
 
 
267 aa  99  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  40.67 
 
 
220 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  38.3 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  37.93 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  32.93 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  37.5 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  31.1 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  38.78 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  34.35 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  33.14 
 
 
194 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  35.16 
 
 
243 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  30.23 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  33.81 
 
 
228 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  33.77 
 
 
248 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  29.11 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  28.12 
 
 
260 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  34.25 
 
 
375 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  27.78 
 
 
144 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  35.15 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  32.56 
 
 
238 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  31.43 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  33.33 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
384 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  33.85 
 
 
298 aa  42.4  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  30.13 
 
 
238 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2531  hypothetical protein  29.14 
 
 
261 aa  41.6  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  27.5 
 
 
197 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>