46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0695 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 		 228 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  61.15 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  50.33 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  29.35 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  38.03 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  39.2 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  37.3 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  39.2 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  37.4 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  35.94 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  32 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  32.54 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  33.6 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  34.68 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  33.1 
 
 		 167 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  29.46 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  30.65 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  34.11 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  33.81 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  39.64 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  32.64 
 
 		 347 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  30.63 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  31.58 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  31.45 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  31.08 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  34.48 
 
 		 946 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  32.99 
 
 		 284 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  33.78 
 
 		 350 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  31.65 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  31.82 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  38.06 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  28.97 
 
 		 368 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  32.05 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  30.56 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  31.51 
 
 		 309 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  32.8 
 
 		 156 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  29.91 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  31.25 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  29.66 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  30.65 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  32.09 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  31.13 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  30.07 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  37.8 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  31.54 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  31.67 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>