50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7838 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
946 aa  1813    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  56.29 
 
 
212 aa  155  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  51.32 
 
 
203 aa  144  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  43.79 
 
 
284 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  42.86 
 
 
225 aa  142  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  47.3 
 
 
368 aa  140  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  51.02 
 
 
214 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  50.63 
 
 
242 aa  134  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  46.94 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  45.7 
 
 
291 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  44.76 
 
 
247 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  47.59 
 
 
298 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  46.79 
 
 
188 aa  129  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  44.76 
 
 
247 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  44.9 
 
 
208 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  45.27 
 
 
276 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  46.36 
 
 
279 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  47.59 
 
 
178 aa  122  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  46.31 
 
 
214 aa  121  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  46.75 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  45.14 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  46.36 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  44.08 
 
 
245 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  45.21 
 
 
347 aa  119  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  44.38 
 
 
235 aa  118  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  45.21 
 
 
309 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  48.65 
 
 
210 aa  112  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  49.67 
 
 
196 aa  111  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  46.71 
 
 
216 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  42.48 
 
 
235 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  40.27 
 
 
213 aa  106  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  45.64 
 
 
167 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  42.28 
 
 
235 aa  99.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  35.33 
 
 
321 aa  90.5  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  40.69 
 
 
226 aa  80.1  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  39.74 
 
 
202 aa  79.7  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  39.74 
 
 
156 aa  76.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  35.42 
 
 
241 aa  72  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  35.57 
 
 
267 aa  70.5  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  39.13 
 
 
222 aa  67.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  34.01 
 
 
220 aa  66.6  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  34.23 
 
 
218 aa  64.7  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  34.25 
 
 
243 aa  63.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  34.46 
 
 
238 aa  62  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  34.21 
 
 
260 aa  55.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  31.01 
 
 
144 aa  55.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  33.63 
 
 
194 aa  54.3  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  36.75 
 
 
226 aa  52.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  34.21 
 
 
228 aa  52  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  34.48 
 
 
228 aa  51.2  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>