65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4206 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  78.35 
 
 		 220 aa  308  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  49.66 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  45.21 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  43.57 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  41.61 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  39.46 
 
 		 368 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  44.14 
 
 		 241 aa  98.6  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  36.13 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  40.38 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  41.26 
 
 		 347 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  38.89 
 
 		 321 aa  94  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  35.37 
 
 		 284 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  39.1 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  41.5 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  39.46 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  41.38 
 
 		 309 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  36.55 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  36.71 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  37.01 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  36.81 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  39.31 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  37.06 
 
 		 156 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  38.46 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  41.38 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  35.92 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  38.73 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  35.92 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  39.19 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  35.81 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  39.04 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  37.93 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  36.3 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  36.55 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  34.67 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  35.66 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  35.86 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  39.17 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  33.76 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  36.73 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  34.48 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  36.3 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  32.68 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  36.13 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  34.23 
 
 		 946 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  34.48 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  31.08 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  35.57 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  31.45 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  32 
 
 		 144 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  36.07 
 
 		 384 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  40.45 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  36.94 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  35.54 
 
 		 375 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  36.94 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  36.04 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  36.04 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  32 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  35.14 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  35.14 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  31.5 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  35.14 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  30.3 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  28.83 
 
 		 208 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  33.67 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>