58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0236 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  100 
 
 
234 aa  486  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  37.39 
 
 
250 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  41.54 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  34.3 
 
 
247 aa  156  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  35.15 
 
 
253 aa  135  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  33.17 
 
 
210 aa  92.8  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.8 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.8 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.8 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  32.14 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.8 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.43 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.43 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  29.29 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  29.29 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.92 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0714  sortase (surface protein transpeptidase)  25 
 
 
331 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0029312  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  27.74 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  24.26 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  29.68 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  27.78 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  28.46 
 
 
272 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  30.83 
 
 
272 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1128  sortase (surface protein transpeptidase)  30.65 
 
 
293 aa  52.8  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.513672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  29.68 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  32.95 
 
 
302 aa  52  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1443  sortase (surface protein transpeptidase)  25.2 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  27.75 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  28.06 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2551  sortase  27.98 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2603  sortase  27.98 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  31.51 
 
 
327 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  27.21 
 
 
298 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  30.4 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2089  sortase  25.79 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  26.37 
 
 
266 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  24.38 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  28.66 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  25.15 
 
 
257 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  31.08 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  27.61 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  27.91 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  27.13 
 
 
384 aa  45.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  27.46 
 
 
270 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  23.91 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  29.1 
 
 
260 aa  45.4  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  28.15 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  25.98 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  26.43 
 
 
316 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  25.34 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  25.98 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  37.5 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  27.45 
 
 
294 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  27.48 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  24.83 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  23.71 
 
 
279 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  30.84 
 
 
276 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  21.62 
 
 
229 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>