45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2089 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2089  sortase  100 
 
 		 203 aa  420  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2603  sortase  71.71 
 
 		 206 aa  312  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2551  sortase  71.71 
 
 		 206 aa  312  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  29.65 
 
 		 250 aa  85.5  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  32.68 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.2 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.56 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.2 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.2 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.2 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.2 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.2 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  25.67 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  25.67 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  25.13 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  25 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  30.71 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  28.45 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  28.02 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  28.31 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  27.15 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  26.46 
 
 		 272 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0714  sortase (surface protein transpeptidase)  29.93 
 
 		 331 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0029312  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  31.18 
 
 		 298 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  25.11 
 
 		 327 aa  52.4  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  26.03 
 
 		 268 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  27.34 
 
 		 316 aa  49.3  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  22.43 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  25.33 
 
 		 266 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  30.77 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  31.2 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  21.5 
 
 		 365 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  24 
 
 		 266 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  25.12 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.25 
 
 		 344 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  29.91 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  25.2 
 
 		 339 aa  45.4  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  26.67 
 
 		 302 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1443  sortase (surface protein transpeptidase)  27.15 
 
 		 284 aa  45.1  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  26.07 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  30 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  31.36 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  28.33 
 
 		 337 aa  42.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  25.42 
 
 		 381 aa  42.4  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  24.03 
 
 		 270 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>