287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2873 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  61.88 
 
 		 234 aa  285  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  56.02 
 
 		 225 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  57.21 
 
 		 227 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  56.22 
 
 		 227 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  57.21 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  56.22 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  57.21 
 
 		 227 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  46.85 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  46.85 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  46.85 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  46.85 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  46.4 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  46.9 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4669  periplasmic chaperone  42.99 
 
 		 276 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  41.35 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  41.43 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0337  periplasmic fimbrial chaperone protein  43.78 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963877  normal  0.0114031 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.91 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  39.47 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  39.91 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  41.81 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  39.91 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  40.52 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  39.47 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  39.47 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  39.37 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  41.67 
 
 		 232 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  41.67 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  41.67 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  41.67 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  40.43 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1530  chaperone protein PsaB precursor  38.27 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000277957  normal  0.0151187 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2758  pili assembly chaperone  38.27 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2677  pili assembly chaperone  38.27 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0736658  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0330  gram-negative pili assembly chaperone  39.5 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  40.09 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.3 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  36.17 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.19 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  36.09 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  39.19 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  39.19 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  39.19 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  38.74 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  41.83 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  39.01 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  38.57 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  38.57 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  38.29 
 
 		 241 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  39.81 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  38.12 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  38.12 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  35.93 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  39.3 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  36.89 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  41.35 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  39.35 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  41.05 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.04 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  38.18 
 
 		 244 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  40.74 
 
 		 256 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  40.74 
 
 		 256 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  40.74 
 
 		 256 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  40.74 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  37 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  36.73 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  39.64 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  40.65 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.53 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  40.19 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.02 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  39.71 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  37.39 
 
 		 240 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  35.95 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  37.66 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  36.94 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  38.53 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  38.81 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  39.71 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  39.71 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.71 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  38.36 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  39.71 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  39.81 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  34.68 
 
 		 249 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  37.97 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  39.23 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  34.67 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  37.34 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  34.67 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  39.64 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  35.11 
 
 		 239 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.12 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  37.13 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.61 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  38.43 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  36 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  38.43 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  38.36 
 
 		 245 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>