291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0562 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  49.03 
 
 		 266 aa  245  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  49.03 
 
 		 266 aa  244  8e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  51.06 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  45.89 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  49.08 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  40.98 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  41.91 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  44.44 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.98 
 
 		 243 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  41.28 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  42.11 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  39.74 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  39.74 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  45.09 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  39.74 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  39.74 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.85 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  45.34 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  44.34 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  44.34 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  42.61 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  44.34 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  39.38 
 
 		 247 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.7 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.26 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  44.02 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  45.26 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  40 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  39.13 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  40.27 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  41.67 
 
 		 245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  39.65 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  41.67 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  41.23 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  43.44 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  40 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  34.76 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  34.76 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  34.76 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  38.7 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  39.52 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  37.97 
 
 		 243 aa  164  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  37.97 
 
 		 243 aa  164  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  37.97 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.48 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  36.74 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  38.71 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  39.06 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  39.18 
 
 		 250 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  40.77 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  37.5 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.2 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.2 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  36.18 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.17 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  40.83 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.59 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  42.27 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  41.3 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  38.6 
 
 		 232 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  35.93 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  38.12 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.3 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  38.6 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  38.6 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  35.5 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  38.6 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  35.02 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  38.27 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.57 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  34.63 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  38.31 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  38.31 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  36.67 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.67 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  36.48 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  36.67 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  36.67 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  34.32 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  36.03 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  40.25 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  40.25 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  40.25 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  40.25 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  37.9 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  36.84 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  37.12 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  37.12 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  36.4 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  36.4 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.4 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  36.4 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  36.4 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  35.59 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  36.68 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  36.68 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  35.96 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  36.68 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  37.32 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>