279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1665 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  98.73 
 
 		 236 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1695  periplasmic pilus chaperone family protein  99.33 
 
 		 149 aa  306  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  60.09 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  60.09 
 
 		 241 aa  289  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  60.09 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  59.65 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  64.9 
 
 		 216 aa  288  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  59.66 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  50.86 
 
 		 234 aa  234  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  48.66 
 
 		 230 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  49.32 
 
 		 230 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  48.66 
 
 		 230 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  49.32 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  48.87 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  49.3 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  49.25 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  49.25 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0025  chaperone protein FimC  49.25 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.263689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0023  chaperone protein FimC  49.25 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.20078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0025  chaperone protein FimC  49.25 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.37249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  46.08 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  45.62 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  45.62 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  45.62 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  45.62 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  45.62 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  45.12 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  45.62 
 
 		 230 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  44.39 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  41.44 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  42.5 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  40.83 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  41.28 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.28 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  41.28 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  41.28 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  40.99 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  40.83 
 
 		 233 aa  164  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  40.97 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  40.97 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  40.97 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  40.53 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  36.76 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  40.38 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  40.38 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  40.38 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.87 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  39.42 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  36.87 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  39.9 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  36.87 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  36.41 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  34.07 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  36.41 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  36.41 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  39.81 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  35.98 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  36.86 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  33.19 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  33.19 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  41.26 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  33.62 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.09 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  35.74 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  35.74 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  35.74 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.24 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  35.47 
 
 		 256 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  33.92 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  38.91 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  36.45 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  36.73 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  33.61 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  35.68 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  32.09 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  32.09 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.47 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.91 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  35.4 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  32.09 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  32.09 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  35.4 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  32.09 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  35.4 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  35.4 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  34.78 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  34.87 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  34.96 
 
 		 247 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  35.59 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  36 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  34.1 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.82 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.59 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  33.77 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  36.57 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  32.19 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  33.76 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  32.19 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  32.19 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>