280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2971 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  100 
 
 
247 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  77.33 
 
 
265 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  52.44 
 
 
250 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  48.26 
 
 
234 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  49.8 
 
 
246 aa  231  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  47.39 
 
 
246 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  49.15 
 
 
251 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  47.44 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  47.44 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  47.44 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  47.44 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  46.38 
 
 
250 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  46.34 
 
 
245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  50.21 
 
 
236 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  46.29 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  47.01 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  43.27 
 
 
241 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  44.9 
 
 
241 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  50.45 
 
 
241 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  48.31 
 
 
244 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  49.58 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  50.67 
 
 
240 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  50.67 
 
 
245 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  45.19 
 
 
247 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  43.72 
 
 
253 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  48.44 
 
 
257 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  43.4 
 
 
248 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  41.18 
 
 
282 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  41.49 
 
 
260 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  44.04 
 
 
250 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.61 
 
 
243 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  42.92 
 
 
248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  38.77 
 
 
253 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  38.33 
 
 
253 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  38.33 
 
 
253 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  42.73 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.81 
 
 
252 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  38.49 
 
 
245 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.75 
 
 
266 aa  175  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  38.08 
 
 
259 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  38.08 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  39.75 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  40.27 
 
 
256 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  40.27 
 
 
256 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  40.27 
 
 
256 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  37.85 
 
 
267 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  37.85 
 
 
267 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  40.27 
 
 
256 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  37.45 
 
 
267 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  41.37 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.82 
 
 
238 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  38.53 
 
 
233 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  37.33 
 
 
250 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.83 
 
 
248 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  36.82 
 
 
243 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  36.82 
 
 
243 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  36.56 
 
 
246 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  41.38 
 
 
267 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  41.38 
 
 
267 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  41.38 
 
 
253 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  39.57 
 
 
309 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  40.43 
 
 
226 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  38.89 
 
 
309 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  35.65 
 
 
243 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  35.65 
 
 
243 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  38.3 
 
 
251 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  38.33 
 
 
248 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  35.65 
 
 
243 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.28 
 
 
266 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.04 
 
 
248 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  35.42 
 
 
250 aa  148  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  37.33 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  34.4 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  39.23 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  39.23 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  32.2 
 
 
225 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  37.29 
 
 
245 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  37.33 
 
 
237 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  35.37 
 
 
241 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  35.37 
 
 
241 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  38.03 
 
 
234 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  35.37 
 
 
241 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  36.32 
 
 
275 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  35.17 
 
 
249 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  32.62 
 
 
242 aa  142  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  37.39 
 
 
237 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  35.17 
 
 
244 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  34.93 
 
 
241 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.13 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.13 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  40 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.93 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  36.99 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  37.17 
 
 
232 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  37.17 
 
 
232 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  37.17 
 
 
232 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  35.17 
 
 
231 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.75 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  37.17 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  37.21 
 
 
228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>