291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0562 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  100 
 
 		 231 aa  477  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  99.57 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  99.57 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  99.13 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  98.7 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  99.13 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  97.32 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  45.13 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  39.73 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  39.73 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  39.73 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  39.73 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  40.43 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  39.91 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  39.91 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  39.47 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  39.47 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  39.47 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  39.47 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  37 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  39.63 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.63 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  39.63 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  39.63 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  39.17 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  36.87 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  39.52 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  36.87 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  37.73 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  37.56 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  38.05 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  38.05 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  37.56 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  38.24 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.02 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  35 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  35 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  35 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  35 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  35 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  35.71 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  36.24 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  35 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  38.64 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  34.74 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  35.74 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  34.75 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  38.17 
 
 		 266 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.86 
 
 		 266 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  37.1 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.94 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  34.55 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  36.4 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  37.16 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  36.07 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  35.22 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  36.7 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  35.12 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  31.6 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  35.12 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0337  periplasmic fimbrial chaperone protein  36.14 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963877  normal  0.0114031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  35.5 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  35.38 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  36.63 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  34.31 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  35.89 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  34.31 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  35.89 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  34.31 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0025  chaperone protein FimC  35.89 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.37249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  33.62 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0025  chaperone protein FimC  35.89 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.263689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  35.19 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0023  chaperone protein FimC  35.75 
 
 		 275 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.20078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  33.74 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  34.25 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  33.77 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  33.74 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  33.33 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  33.74 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  34.65 
 
 		 256 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  34.65 
 
 		 256 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  34.65 
 
 		 256 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.11 
 
 		 252 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  34.25 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  32.05 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.25 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  34.25 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.98 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  34.25 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  32.74 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.89 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.17 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  34.21 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  35.71 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  33.33 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  33.33 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  34.86 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  33.79 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0330  gram-negative pili assembly chaperone  35.9 
 
 		 201 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>