298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0200 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  100 
 
 		 227 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  98.68 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  98.68 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  97.8 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  96.92 
 
 		 227 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  55.61 
 
 		 225 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  54.95 
 
 		 226 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  50 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  42.99 
 
 		 227 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  42.53 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  42.53 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  42.53 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  42.53 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0337  periplasmic fimbrial chaperone protein  41.29 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963877  normal  0.0114031 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  37.27 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  40.38 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  40.69 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  39.38 
 
 		 236 aa  161  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2758  pili assembly chaperone  36.51 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1530  chaperone protein PsaB precursor  36.51 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000277957  normal  0.0151187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  39.38 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2677  pili assembly chaperone  36.51 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0736658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  39.01 
 
 		 241 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  39.01 
 
 		 241 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.01 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  39.01 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  38.57 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4669  periplasmic chaperone  36.82 
 
 		 276 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0330  gram-negative pili assembly chaperone  40.21 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  38.94 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  40.2 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  37.85 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.38 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  38.5 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  36.82 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  37.38 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  37.38 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  37.38 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  37.38 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  39.63 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  39.63 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.63 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  39.63 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  37.38 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  39.63 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  39.11 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  39.11 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  38.43 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  39.17 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  39.11 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  39.11 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  39.11 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  38.71 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  37.61 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  36.07 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  33.94 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  33.94 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.87 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  37.07 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  37.07 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  37.07 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  37.07 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  34.38 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  34.38 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.38 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  35.24 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  34.38 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  36.61 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  34.25 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  34.38 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  33.78 
 
 		 264 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  36.61 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  36.32 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  36.32 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  36.32 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  34.06 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  34.11 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.4 
 
 		 265 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  33.93 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.33 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.33 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.33 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.33 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  33.33 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.97 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  36.32 
 
 		 249 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  33.93 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  35.44 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0030  fimbrial chaperone  36.76 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.75 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  32.75 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  33.8 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  33.03 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  33.05 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0030  fimbrial chaperone  36.27 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  35.37 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0028  fimbrial chaperone  36.5 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  0.10634 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.61 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  37.5 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  37.5 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>