285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3519 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  85.06 
 
 		 241 aa  434  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  61.57 
 
 		 245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  60.32 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  60.32 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  59.92 
 
 		 246 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  59.92 
 
 		 246 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  58.3 
 
 		 246 aa  295  6e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  57.09 
 
 		 247 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  56.91 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  51.8 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  53.27 
 
 		 250 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  48.13 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  46.28 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  46.22 
 
 		 234 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  46.69 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  43.27 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  46.78 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  47.98 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.62 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  48.43 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  47.98 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  48 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  45.02 
 
 		 266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  45.02 
 
 		 266 aa  211  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  47.06 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  44.49 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  44.49 
 
 		 253 aa  201  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  43.81 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  44.49 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  43.81 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  43.36 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.98 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  41.28 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  40.5 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  40.69 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  40.17 
 
 		 248 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  38.08 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  39.46 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  38.27 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  43.19 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.34 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.52 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  40.26 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  40.66 
 
 		 267 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  40.66 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  40.66 
 
 		 267 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  39.32 
 
 		 309 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  37.93 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  40.69 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  40.25 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  38.52 
 
 		 243 aa  161  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  38.52 
 
 		 243 aa  161  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  38.52 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  39.73 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.75 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  40.18 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.63 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  35.81 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  34.68 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  38.89 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.58 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.58 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  35.35 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.58 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  35.62 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  37.87 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  37.87 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  37.6 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  37.87 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  35.27 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  36.7 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  35.93 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  33.62 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  36.93 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  36.93 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  36.93 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  34.62 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  34.31 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  36.74 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  37.87 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.61 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  39.61 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  39.61 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  39.61 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  32.75 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  35.78 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  37.63 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  33.77 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  35.06 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  35.06 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  33.77 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  35.06 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  38.86 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  32.75 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  38.07 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  33.9 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  33.78 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  32.49 
 
 		 243 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  31.25 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>