275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1790 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  98.88 
 
 
267 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  37.85 
 
 
247 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  36.32 
 
 
234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  37.86 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.71 
 
 
265 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  37.39 
 
 
250 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  37.94 
 
 
246 aa  148  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.31 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  35.43 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.92 
 
 
250 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  38.04 
 
 
245 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  35.18 
 
 
247 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  36.93 
 
 
241 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  36.11 
 
 
246 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  36.11 
 
 
246 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  36.11 
 
 
246 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  36.11 
 
 
246 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  34.89 
 
 
272 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  34.89 
 
 
244 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  34.89 
 
 
244 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  34.92 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.71 
 
 
246 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  34.73 
 
 
245 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.12 
 
 
243 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  36.18 
 
 
248 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  34.73 
 
 
259 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  35.08 
 
 
253 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  35.08 
 
 
253 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  34.73 
 
 
245 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  36.25 
 
 
241 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  34.68 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  36.68 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.74 
 
 
266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.57 
 
 
244 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  34.08 
 
 
233 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  33.33 
 
 
266 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  32.76 
 
 
241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  37.04 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  29.55 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  34.63 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  36.6 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  35.06 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  33.87 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  33.87 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  33.87 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  32.94 
 
 
260 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
249 aa  125  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  32.92 
 
 
236 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  31.3 
 
 
248 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  33.77 
 
 
240 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  33.62 
 
 
245 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  34.85 
 
 
226 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  32 
 
 
252 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  33.61 
 
 
256 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  30.67 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
243 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
243 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  34.98 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  34.55 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  34.55 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  34.55 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
243 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  34.15 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  35.39 
 
 
227 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  34.16 
 
 
267 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  34.75 
 
 
309 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  31.36 
 
 
237 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  34.16 
 
 
267 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  34.75 
 
 
253 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.35 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  36.1 
 
 
229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  33.76 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  33.18 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  33.33 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  33.74 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  34.19 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.02 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  33.76 
 
 
227 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  33.47 
 
 
239 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  33.76 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  32.91 
 
 
231 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  32.76 
 
 
237 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  33.06 
 
 
224 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  34.02 
 
 
230 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.05 
 
 
248 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30.74 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  30.16 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.96 
 
 
249 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  36.1 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  34.71 
 
 
224 aa  112  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  33.76 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  32.77 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  30.16 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  33.61 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  33.61 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  33.78 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.53 
 
 
252 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>