More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1695 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  58.93 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  54.26 
 
 
234 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  55.16 
 
 
250 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  46.8 
 
 
250 aa  224  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  45.49 
 
 
241 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  45.04 
 
 
241 aa  221  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  50.22 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  44.62 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  43.97 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  49.32 
 
 
250 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  48.44 
 
 
247 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  46.25 
 
 
256 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.78 
 
 
265 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  42.86 
 
 
246 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  42.86 
 
 
246 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  43.62 
 
 
245 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  42.46 
 
 
246 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  42.46 
 
 
246 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  47.66 
 
 
243 aa  204  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.86 
 
 
246 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  45.87 
 
 
266 aa  198  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  45.04 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  45.87 
 
 
282 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  44.44 
 
 
253 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  45.13 
 
 
241 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  43.36 
 
 
236 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  43.36 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  43.36 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  40.59 
 
 
248 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  47.28 
 
 
244 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  40.35 
 
 
260 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  48 
 
 
243 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  39.18 
 
 
253 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  39.18 
 
 
253 aa  175  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  39.18 
 
 
253 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  42.17 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  41.41 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.39 
 
 
238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  40.42 
 
 
248 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  44.09 
 
 
233 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  39.15 
 
 
248 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  36.63 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  40.98 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  38.2 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  36.55 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  38.2 
 
 
245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  37.77 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  38.52 
 
 
248 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  42.34 
 
 
248 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  37.19 
 
 
243 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  36.1 
 
 
243 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  36.1 
 
 
243 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.44 
 
 
248 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.26 
 
 
252 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  34.02 
 
 
249 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.02 
 
 
248 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  40.24 
 
 
234 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.49 
 
 
266 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.86 
 
 
247 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.86 
 
 
247 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  38.07 
 
 
250 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  37.85 
 
 
248 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  40.58 
 
 
224 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.58 
 
 
224 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  40.58 
 
 
224 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  40.58 
 
 
224 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  35.81 
 
 
229 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  36.82 
 
 
242 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.25 
 
 
231 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  37.68 
 
 
224 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.866269 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  35.25 
 
 
231 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  35.25 
 
 
231 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  34.84 
 
 
231 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  35.25 
 
 
231 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  35.25 
 
 
231 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  38.86 
 
 
231 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  36.14 
 
 
267 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  36.14 
 
 
267 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  34.18 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  34.18 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  37.24 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  35.11 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  37.24 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  37.24 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  34.63 
 
 
250 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  36.07 
 
 
224 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  37.95 
 
 
309 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  35.74 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  37.24 
 
 
309 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  36.19 
 
 
227 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2385  gram-negative pilus assembly chaperone  36.19 
 
 
227 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.560587  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  35.06 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  36.41 
 
 
260 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  34.11 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  34.45 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  33.79 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  33.79 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  35.55 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.63 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>