278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4154 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  43.9 
 
 
224 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.866269 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  43 
 
 
224 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  43 
 
 
224 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  43 
 
 
224 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  38.33 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  43 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  39.19 
 
 
226 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  38.33 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  37.34 
 
 
249 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  36.77 
 
 
245 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  36.77 
 
 
245 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.06 
 
 
243 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  39.25 
 
 
227 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2385  gram-negative pilus assembly chaperone  39.25 
 
 
227 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.560587  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  36.32 
 
 
259 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.61 
 
 
243 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  38.77 
 
 
236 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  39.27 
 
 
240 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  45.71 
 
 
256 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  36.68 
 
 
252 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  39.27 
 
 
245 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  39.27 
 
 
241 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  37.5 
 
 
233 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  34.85 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0023  pili assembly chaperone  39.45 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000753719  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.53 
 
 
250 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  41.36 
 
 
246 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  41.36 
 
 
246 aa  144  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  41.36 
 
 
246 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  41.36 
 
 
246 aa  144  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.44 
 
 
266 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.62 
 
 
246 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  39.36 
 
 
250 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  39.78 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  40 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  35.59 
 
 
241 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  50.38 
 
 
257 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  37.63 
 
 
241 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  37.55 
 
 
247 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.47 
 
 
244 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  38.73 
 
 
246 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  38.36 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  37.93 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  37.93 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  34.68 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  32 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  34.93 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  37.93 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  39.58 
 
 
243 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  39.58 
 
 
243 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.13 
 
 
265 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  31.92 
 
 
238 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  39.58 
 
 
243 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  37.93 
 
 
309 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  38.04 
 
 
251 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.84 
 
 
248 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  34.2 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  36.53 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  38.5 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  34.2 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  35.34 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  35.9 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  35.34 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  33.77 
 
 
253 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  38.69 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  35.96 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  31.74 
 
 
252 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  38.14 
 
 
248 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  43.51 
 
 
253 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.22 
 
 
266 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  34.08 
 
 
248 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  36.61 
 
 
230 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  41.06 
 
 
260 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  34.39 
 
 
246 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  34.39 
 
 
246 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.49 
 
 
252 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  33.98 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  32.88 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  33.5 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  31.7 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  36.49 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  33.98 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  34.39 
 
 
226 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  32.48 
 
 
234 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  33.5 
 
 
227 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  33.01 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0302  pili assembly chaperone  29.82 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  32.42 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  32.42 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  32.42 
 
 
272 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.93 
 
 
234 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3019  chaperone CupA5  33.33 
 
 
238 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  35.07 
 
 
230 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  33.62 
 
 
236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  30.13 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  30.13 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  33.62 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  30.13 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  33.18 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>