More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0839 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  100 
 
 		 251 aa  510  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  58.74 
 
 		 234 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  58.93 
 
 		 257 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  57.66 
 
 		 250 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  55.75 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  49.15 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  46.91 
 
 		 241 aa  224  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  48.13 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  46.44 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  48.32 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  45.31 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  51.28 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  44.14 
 
 		 256 aa  205  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  44.53 
 
 		 245 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  44.26 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  42.29 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  42.29 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  41.9 
 
 		 246 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  41.9 
 
 		 246 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  45.89 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.73 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  45.09 
 
 		 241 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  42.8 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.86 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  43.75 
 
 		 240 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  43.75 
 
 		 245 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  45.26 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  42.86 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  41.49 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.39 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  43.11 
 
 		 250 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  42.08 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  42.13 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.28 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  41.41 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  41.41 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  41.41 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  40.5 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  40.36 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  39.13 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  38.89 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  40 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  38.7 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.99 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  39.53 
 
 		 233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  38.4 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  37.86 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  37.86 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  38.11 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.52 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.3 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  38.34 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  36.24 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  39.5 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  35.78 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  35.78 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  38.67 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.61 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  38.05 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  37.82 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  37.04 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  37.82 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  36.05 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  33.94 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.32 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.32 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  34.76 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  34.76 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  33.19 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.65 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  36.32 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.46 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  36.2 
 
 		 224 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  36.77 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  36.77 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  37.67 
 
 		 248 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  36.77 
 
 		 231 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  36.77 
 
 		 231 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.1 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  35.48 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  36.82 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  35.59 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  36.94 
 
 		 250 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  33.82 
 
 		 229 aa  135  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  34.36 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  35.8 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  38.04 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  35.39 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  35.32 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  35.65 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.65 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  35.65 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  35.65 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  34.11 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  34.86 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  37 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  37.5 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  34.98 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2829  pili assembly chaperone  30.86 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  34.86 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>