295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3754 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  56.43 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  50.65 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  50.7 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  47.64 
 
 		 247 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  47.64 
 
 		 247 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  44.49 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  50 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  43.1 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  42.22 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  42.37 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  40.85 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  38.4 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  41.2 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  41.78 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  40.18 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  39.73 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  40.97 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  39.32 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.2 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  38.33 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  41.2 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  41.07 
 
 		 236 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.06 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  42.13 
 
 		 240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  42.13 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  39.29 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.95 
 
 		 265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.03 
 
 		 243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  37.77 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.3 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  38.01 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  38.11 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  38.12 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  36.68 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  40 
 
 		 256 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  40 
 
 		 256 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  40 
 
 		 256 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  40 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  39.91 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  38.39 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.56 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  36.74 
 
 		 225 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.38 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  38.53 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  38.86 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  38.86 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  38.86 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  41.81 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  38.86 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  35.84 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.43 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  37.5 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  37.02 
 
 		 282 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  36.96 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  35.56 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  42.46 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  42.46 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  42.46 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  42.46 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  35.56 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  39.17 
 
 		 244 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  34.45 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  35.09 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  35.09 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  38.99 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  35.09 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  38.53 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  38.53 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  38.53 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  35.92 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  38.53 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  36.73 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  32.77 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  32.77 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  32.77 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  36.94 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  38.5 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  36.94 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.22 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  37.22 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  36.49 
 
 		 241 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.47 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  34.67 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  36.96 
 
 		 245 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  36 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.71 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  39.15 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  37.16 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  39.15 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  35.59 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0025  chaperone protein FimC  39.15 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.263689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0025  chaperone protein FimC  39.15 
 
 		 275 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.37249  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  35.29 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  35.29 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  35.29 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  35.29 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  33.81 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  37.16 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  32.6 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>