286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1818 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  100 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  51.06 
 
 		 243 aa  221  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  47.68 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  47.68 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  42.91 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  37.86 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  41.78 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  38.08 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  43.69 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  42.57 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  40.43 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  40.5 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  40.43 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  37.75 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  37.75 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  40.44 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  40.93 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  37.75 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  37.75 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.35 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  40 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  41.13 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  41.13 
 
 		 245 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  40.69 
 
 		 241 aa  168  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  39.84 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  44.05 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  37.7 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.42 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  39.57 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  38.27 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  41.37 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  39.32 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  37.34 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  35.42 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  35.42 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  38.18 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  33.47 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.47 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  33.47 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  33.47 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  35.74 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  35 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  35.41 
 
 		 248 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  38.06 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.93 
 
 		 243 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.52 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  37.11 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0023  pili assembly chaperone  34.62 
 
 		 227 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000753719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.89 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.67 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.01 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  36.51 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  36.51 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  36.51 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  36.67 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2385  gram-negative pilus assembly chaperone  34.73 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.560587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  34.73 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  37.14 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  36.73 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  36.73 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  36.73 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  33.05 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  35.92 
 
 		 309 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  34.32 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  33.47 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  36.25 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  35.83 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  35.83 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  35.74 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  35.54 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  37.13 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  37.28 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.84 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.22 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  35.22 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  35.22 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  35.22 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  35.22 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.38 
 
 		 248 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  32.02 
 
 		 234 aa  131  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  34.78 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  34.82 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  35.66 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  35.47 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  32.66 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30.77 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  35.92 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  36.77 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  32.66 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  32.66 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  36.17 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  34.31 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  36.36 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  34.36 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  33.06 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  34.85 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  34.43 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  34.85 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  34.19 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  33.91 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>