More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51460 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  100 
 
 
237 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  57.21 
 
 
238 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  46.9 
 
 
249 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  44.49 
 
 
248 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.27 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  41.99 
 
 
247 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.29 
 
 
247 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.29 
 
 
247 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  40.45 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  39.83 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.43 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  38.62 
 
 
245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  40.36 
 
 
251 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  39.64 
 
 
250 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  42.15 
 
 
256 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  42.15 
 
 
256 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  42.15 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  42.15 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  40.69 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  41.41 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  38.71 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  39.46 
 
 
241 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  37.34 
 
 
246 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  39.01 
 
 
250 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.18 
 
 
243 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.67 
 
 
250 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  36.48 
 
 
246 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  36.48 
 
 
246 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  36.48 
 
 
246 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  36.48 
 
 
246 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  36.8 
 
 
253 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  39.46 
 
 
234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  38.25 
 
 
227 aa  151  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.89 
 
 
246 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4406  chaperone CupC2  55.22 
 
 
133 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  37.1 
 
 
248 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  39.46 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  38.36 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.83 
 
 
265 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  37.67 
 
 
236 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  37.33 
 
 
225 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  37.9 
 
 
245 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  35.94 
 
 
244 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  37.9 
 
 
240 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  41.26 
 
 
236 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  35.54 
 
 
252 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  34.38 
 
 
259 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  37.39 
 
 
247 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  41.26 
 
 
236 aa  141  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.77 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  38.97 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  40.65 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  31.15 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  40.19 
 
 
234 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  34.1 
 
 
260 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  36.24 
 
 
237 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  36.99 
 
 
251 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  36.12 
 
 
248 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  34.68 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  33.18 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  35.37 
 
 
230 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  35.37 
 
 
230 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  35.37 
 
 
230 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  35.37 
 
 
230 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  34.4 
 
 
243 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  34.4 
 
 
243 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  35.66 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  35.66 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  34.4 
 
 
243 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  32.64 
 
 
242 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  32.49 
 
 
260 aa  131  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  35.25 
 
 
253 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.41 
 
 
266 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  35.84 
 
 
227 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  36 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  36 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  35.35 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  36 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  35.02 
 
 
266 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  35.4 
 
 
227 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  34.82 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  37.22 
 
 
230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  37.22 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  37.61 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  36.7 
 
 
230 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  36.77 
 
 
230 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.77 
 
 
230 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  36.77 
 
 
230 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  36.77 
 
 
230 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  36.56 
 
 
232 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  36.56 
 
 
232 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  36.56 
 
 
232 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  36.56 
 
 
232 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  34.35 
 
 
249 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  35.43 
 
 
230 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  33.02 
 
 
248 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  35.55 
 
 
248 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  30.41 
 
 
234 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.63 
 
 
252 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>