299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0762 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  82.66 
 
 		 248 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  80.24 
 
 		 247 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  80.24 
 
 		 247 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  50.65 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  50.22 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  46.76 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  40.99 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  41.02 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  41.08 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  41.15 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  40.76 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.38 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  39.38 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  39.38 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  39.38 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  39.38 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  38.67 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  37.97 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  36.71 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  40.53 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  37.29 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  38.7 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  38.63 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  36.68 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  37.5 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  37.5 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  37.5 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  37.44 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  38.22 
 
 		 227 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  36.7 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  38.79 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  38.07 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  34.18 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  39.25 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  35.43 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  35.68 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.76 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.61 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  39.07 
 
 		 250 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.85 
 
 		 250 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  36.49 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  38.4 
 
 		 226 aa  138  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.62 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.34 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  34.96 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  37 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  35.53 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  37.95 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  37.95 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  37.95 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  37.95 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  35.53 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  36.08 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  35.09 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  35.43 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  35.78 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  34.32 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.42 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  34.8 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.2 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  36.02 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  35.95 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  34.76 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  33.98 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  31.7 
 
 		 253 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  31.7 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  33.02 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  34.85 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  31.25 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  32.91 
 
 		 243 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  32.55 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  32.47 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  32.47 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  33.63 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  33.63 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  34.62 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  33.63 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  34.63 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.07 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  32.55 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.19 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  33.64 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  34.43 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.34 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  34.19 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  34.63 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  33.64 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  32.92 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  36.32 
 
 		 236 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  34.63 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  36.32 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  33.64 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  34.19 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  34.63 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  35.06 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  34.19 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  34.19 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  35.8 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  32.03 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>