281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0824 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  100 
 
 		 249 aa  520  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  81.53 
 
 		 249 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  46.79 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  45.85 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  42.54 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  42.54 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  42.54 
 
 		 239 aa  211  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  41.39 
 
 		 248 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  44.34 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.57 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  40.74 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  40.83 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  40.33 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  42.4 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  42.4 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  42.4 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  44.44 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  40.81 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.98 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  41.94 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  41.96 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  43.3 
 
 		 250 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  43.3 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  41.07 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  43.3 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  41.07 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  43.3 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  43.56 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  39.41 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  40.62 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  42.4 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  42.4 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  42.4 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  42.4 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  42.4 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  42.4 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  41.94 
 
 		 257 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  41.94 
 
 		 257 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  41.94 
 
 		 257 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  41.94 
 
 		 257 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  43.63 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  41.67 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.42 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  36.73 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  36.73 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  36.73 
 
 		 243 aa  158  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  36.28 
 
 		 243 aa  158  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  36.28 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  34.01 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  36.53 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  36.03 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  36.03 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  33.61 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  35.2 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  33.47 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  35.2 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  35.2 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  33.47 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  33.33 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04795  chaperone PapD  36.09 
 
 		 239 aa  135  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  33.77 
 
 		 227 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  32.92 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  31.25 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.34 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  32.29 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.88 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.2 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  32.53 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  32.53 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  32.8 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  32.8 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  31.22 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  34.45 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  32.3 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  30.96 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  30.96 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  32.88 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  32.88 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  32.88 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  32.88 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  31.49 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  31.38 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  32.43 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  29.55 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.19 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.67 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  31.91 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  29.44 
 
 		 224 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  30.2 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  33.2 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  28.38 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  28.38 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  28.38 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  31.56 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  33.03 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  30.33 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.86 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  28.81 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>