276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3173 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  55.9 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  55.9 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  55.46 
 
 		 250 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  55.46 
 
 		 250 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  51.81 
 
 		 252 aa  254  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  51.05 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  49.79 
 
 		 252 aa  244  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  52.73 
 
 		 251 aa  244  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  53.36 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  50.42 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  50.42 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  50.42 
 
 		 250 aa  238  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  53.42 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  49.39 
 
 		 255 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  52.47 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  54.19 
 
 		 230 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  43.93 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  43.93 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  43.93 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  42.45 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  42.45 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  42.04 
 
 		 242 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  42.42 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.32 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  41.41 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  40.99 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.83 
 
 		 242 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.94 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  40.99 
 
 		 243 aa  184  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  40.09 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  43.06 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  40.99 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  40.99 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  42.86 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  42.73 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  40.83 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  40.83 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  41.94 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  41.01 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  41.47 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  41.01 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  41.47 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  41.01 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  41.01 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  41.01 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.08 
 
 		 249 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  35.68 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  34.4 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  35.39 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  35.39 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  33.89 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.89 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  33.89 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  34.16 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  34.8 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  34.8 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  34.55 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04795  chaperone PapD  32.31 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  34.7 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  33.33 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  29.15 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  29.6 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  36.48 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  30.67 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  32.76 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.05 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  28.25 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  35.54 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  32.2 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  31.74 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  37.96 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  32.35 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  32.37 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  32.37 
 
 		 267 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  35.02 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  32.1 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.7 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  31.54 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  35.02 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.06 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  32.37 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  32.1 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  30.7 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  30.7 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  32.1 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  30.7 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  31.69 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  39.26 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  35.02 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  35.02 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.89 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  31.12 
 
 		 309 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.6 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.1 
 
 		 241 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  31.33 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  33.19 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>