279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2246 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  99.55 
 
 
224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  87.95 
 
 
224 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  64.73 
 
 
227 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2385  gram-negative pilus assembly chaperone  64.73 
 
 
227 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.560587  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0023  pili assembly chaperone  55.8 
 
 
227 aa  278  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000753719  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  57.59 
 
 
226 aa  271  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  58.04 
 
 
226 aa  271  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  56.7 
 
 
226 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  43 
 
 
231 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  33.47 
 
 
249 aa  159  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  41.04 
 
 
250 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.67 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  36.32 
 
 
233 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.13 
 
 
243 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  39.61 
 
 
241 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  49.24 
 
 
257 aa  138  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  44.2 
 
 
246 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  33.02 
 
 
248 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  36.7 
 
 
247 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  36.61 
 
 
282 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  33.75 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  32.74 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.75 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  37.8 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  33.33 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  33.49 
 
 
245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  33.93 
 
 
243 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  34.25 
 
 
245 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.57 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  33.93 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  33.79 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  36.51 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.19 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  36.51 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  36.17 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  36.51 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  37.56 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  37.56 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  35.65 
 
 
251 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  35.37 
 
 
245 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  37.56 
 
 
243 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  36.84 
 
 
246 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  34.1 
 
 
234 aa  127  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  34.7 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  33.62 
 
 
253 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  33.62 
 
 
253 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  33.62 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  36.36 
 
 
246 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  36.36 
 
 
246 aa  125  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  36.36 
 
 
246 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  36.36 
 
 
246 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.65 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  34.86 
 
 
247 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  44.35 
 
 
253 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  32.26 
 
 
225 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.17 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  31.02 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.28 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  40.28 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  40.28 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  40.28 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  40.88 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  37.34 
 
 
309 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  35.83 
 
 
309 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  31.84 
 
 
239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  31.84 
 
 
239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  31.98 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  39.86 
 
 
242 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  40.58 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  37.04 
 
 
248 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  32.89 
 
 
255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  31.67 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.87 
 
 
248 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  32.14 
 
 
249 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  33.91 
 
 
252 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  31.46 
 
 
248 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  32.14 
 
 
242 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.46 
 
 
248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  31.51 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  29.52 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  34.71 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  34.71 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  38.6 
 
 
267 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  31.34 
 
 
231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.82 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  29.57 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  31.34 
 
 
231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  31.34 
 
 
231 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  31.34 
 
 
231 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.34 
 
 
231 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  29 
 
 
249 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  33.33 
 
 
250 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  29.67 
 
 
263 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2109  pili assembly chaperone  30.32 
 
 
214 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0135661  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  30.37 
 
 
224 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  29.67 
 
 
248 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  29.67 
 
 
263 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>