273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00666 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  100 
 
 		 243 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  97.27 
 
 		 243 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  97.27 
 
 		 243 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  97.27 
 
 		 243 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  96.82 
 
 		 243 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  92.73 
 
 		 242 aa  437  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  79.55 
 
 		 243 aa  381  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  52.05 
 
 		 255 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  51.6 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  51.14 
 
 		 242 aa  232  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  41.01 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  41.01 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  41.01 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  41.01 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  40.09 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.09 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  40.09 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  40.09 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  40.09 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  38.68 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  40.55 
 
 		 252 aa  168  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  40.64 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  43.6 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  40.47 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  40.47 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  43.6 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  40.47 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  43.6 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  43.6 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  38.86 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  38.86 
 
 		 247 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  40.74 
 
 		 250 aa  161  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  38.86 
 
 		 247 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  38.86 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  38.86 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  38.46 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.29 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  40 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  39.01 
 
 		 250 aa  154  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  39.01 
 
 		 250 aa  154  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  37.74 
 
 		 250 aa  154  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  40.3 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.53 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  37.04 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  38.12 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  36.11 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.32 
 
 		 249 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  33.49 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  33.49 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  33.49 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  33.49 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  33.49 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  33.49 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  33.49 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  33.49 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  33.49 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  32.56 
 
 		 248 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  33.02 
 
 		 248 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  33.49 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.56 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04795  chaperone PapD  32.13 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  36.23 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  36.23 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  36.23 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  36.23 
 
 		 237 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  36.23 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  34.52 
 
 		 236 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  34.52 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  32.06 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  34.52 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  34.01 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  34.01 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.01 
 
 		 241 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  34.01 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  34.01 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  30.69 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  33.99 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  31.19 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  32.84 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  30.94 
 
 		 241 aa  104  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  30.43 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.73 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  30.92 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  30.81 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  34.29 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  34.95 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  34.95 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  34.95 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.95 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  33.97 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  34.95 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  29.13 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  31.66 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  34.95 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  30.48 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  30.3 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  31.66 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  30.3 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  30.48 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>