282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3362 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  100 
 
 		 247 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  100 
 
 		 247 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  98.79 
 
 		 247 aa  500  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  98.79 
 
 		 247 aa  500  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  97.98 
 
 		 247 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  45.34 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  45.34 
 
 		 249 aa  201  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  45.34 
 
 		 242 aa  201  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  38.89 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  40.28 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  40.83 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.81 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  40.18 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  37.29 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  37.29 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  40.37 
 
 		 243 aa  168  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  39.91 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  39.91 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  39.91 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  40.09 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  40.09 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  37.29 
 
 		 239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  38.99 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  39.27 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  38.78 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  39.66 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  40.72 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  38.86 
 
 		 220 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  40.72 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.8 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  40.27 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  38.39 
 
 		 248 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  35.39 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  35.39 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  35.39 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  35.39 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  35.83 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  39.07 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352818 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.87 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.03 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  36.87 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  38.24 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  37.86 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.86 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  37.86 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  39.19 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  37.75 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  36.51 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  38.6 
 
 		 246 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  36.52 
 
 		 249 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  38.6 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  38.6 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  38.6 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  38.6 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  38.6 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  36.1 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  34.51 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  34.51 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  34.07 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  34.07 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  38.46 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  38.01 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  38.01 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  38.01 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.56 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.3 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  39.13 
 
 		 216 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  35.4 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  35.4 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  34.8 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  32.89 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  35.75 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  33.33 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  35.58 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  33.33 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.77 
 
 		 232 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.77 
 
 		 232 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.77 
 
 		 232 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  35.75 
 
 		 227 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.77 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  33.48 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  34.3 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  35.58 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  35.27 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  33.33 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  34.65 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  32.72 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  32.85 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  31.7 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.76 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  31.6 
 
 		 227 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  31.6 
 
 		 227 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  31.46 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  35.16 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  32.23 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  32.23 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  35.11 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>