274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0765 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  100 
 
 
243 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  98.77 
 
 
243 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  97.94 
 
 
243 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  97.94 
 
 
243 aa  485  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  97.12 
 
 
243 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  89.67 
 
 
242 aa  461  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  96.82 
 
 
220 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  79.01 
 
 
243 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  48.31 
 
 
255 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  47.88 
 
 
249 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  47.46 
 
 
242 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  41.15 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  41.15 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  41.15 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  41.15 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  39.65 
 
 
249 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  39.65 
 
 
249 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.65 
 
 
249 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  37.45 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  37.45 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  36.63 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  39.02 
 
 
250 aa  174  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  41.05 
 
 
247 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  40.87 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  40.87 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  40.87 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  41.05 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  41.05 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  40.87 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  39.24 
 
 
239 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  39.24 
 
 
239 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  39.24 
 
 
239 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  38.84 
 
 
250 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  38.84 
 
 
250 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  39.39 
 
 
255 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  40.17 
 
 
247 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  40.17 
 
 
247 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  40.57 
 
 
252 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  38.02 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  38.67 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.33 
 
 
250 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  37.33 
 
 
250 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  35 
 
 
252 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.32 
 
 
249 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  36.77 
 
 
250 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  38.92 
 
 
230 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  35.56 
 
 
241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.78 
 
 
249 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.61 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  34.55 
 
 
248 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  34.72 
 
 
248 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  34.7 
 
 
248 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  34.72 
 
 
263 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  34.72 
 
 
248 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  34.27 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  34.27 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  34.27 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  34.27 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  34.27 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  34.27 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  34.72 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04795  chaperone PapD  31.96 
 
 
239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  34.67 
 
 
236 aa  121  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  34.67 
 
 
236 aa  121  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  35.78 
 
 
237 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  35.78 
 
 
230 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  35.78 
 
 
230 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  35.78 
 
 
230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  35.78 
 
 
230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  32.88 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  32.59 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  32.3 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  31.86 
 
 
241 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  31.86 
 
 
241 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  29.52 
 
 
243 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  32.88 
 
 
225 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  31.86 
 
 
241 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  31.09 
 
 
241 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  32.24 
 
 
216 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.86 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  30.48 
 
 
243 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.2 
 
 
243 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  28.63 
 
 
231 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  31.6 
 
 
227 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
226 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  30.67 
 
 
259 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  33.53 
 
 
228 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  31.42 
 
 
224 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  34.39 
 
 
245 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.49 
 
 
248 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  31.6 
 
 
227 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  29.82 
 
 
229 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  30.99 
 
 
227 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  31.13 
 
 
227 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  29.63 
 
 
232 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.97 
 
 
224 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  30.97 
 
 
224 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  30.97 
 
 
224 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  28.77 
 
 
233 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  29.17 
 
 
232 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>